Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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