Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms