Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC30.82■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
GOLGA3Q08378 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
GOLGA3Q08378 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms