Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms