Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA5Q01523 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms