Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDPQ00604 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDPQ00604 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDPQ00604 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDPQ00604 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDPQ00604 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDPQ00604 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDPQ00604 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NDPQ00604 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NDPQ00604 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDPQ00604 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDPQ00604 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDPQ00604 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NDPQ00604 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NDPQ00604 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDPQ00604 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDPQ00604 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDPQ00604 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDPQ00604 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDPQ00604 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDPQ00604 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDPQ00604 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDPQ00604 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDPQ00604 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDPQ00604 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDPQ00604 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDPQ00604 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDPQ00604 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDPQ00604 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDPQ00604 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NDPQ00604 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDPQ00604 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDPQ00604 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDPQ00604 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDPQ00604 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NDPQ00604 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NDPQ00604 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDPQ00604 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDPQ00604 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDPQ00604 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NDPQ00604 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDPQ00604 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDPQ00604 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NDPQ00604 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDPQ00604 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDPQ00604 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDPQ00604 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NDPQ00604 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDPQ00604 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDPQ00604 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDPQ00604 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDPQ00604 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NDPQ00604 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NDPQ00604 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDPQ00604 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDPQ00604 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDPQ00604 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDPQ00604 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDPQ00604 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDPQ00604 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDPQ00604 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDPQ00604 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDPQ00604 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms