Protein–RNA interactions for Protein: P98177

FOXO4, Forkhead box protein O4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO4P98177 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOXO4P98177 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms