Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms