Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IP78347 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms