Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF3P61204 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF3P61204 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF3P61204 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF3P61204 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF3P61204 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF3P61204 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF3P61204 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF3P61204 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF3P61204 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF3P61204 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF3P61204 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF3P61204 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF3P61204 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF3P61204 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF3P61204 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF3P61204 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF3P61204 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF3P61204 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF3P61204 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF3P61204 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF3P61204 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF3P61204 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF3P61204 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF3P61204 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF3P61204 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF3P61204 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF3P61204 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF3P61204 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF3P61204 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF3P61204 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF3P61204 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF3P61204 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF3P61204 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF3P61204 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF3P61204 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF3P61204 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF3P61204 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF3P61204 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF3P61204 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF3P61204 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF3P61204 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF3P61204 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF3P61204 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF3P61204 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF3P61204 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF3P61204 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF3P61204 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF3P61204 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF3P61204 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF3P61204 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF3P61204 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF3P61204 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF3P61204 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF3P61204 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF3P61204 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF3P61204 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF3P61204 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF3P61204 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF3P61204 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF3P61204 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF3P61204 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF3P61204 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF3P61204 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF3P61204 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF3P61204 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF3P61204 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF3P61204 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ARF3P61204 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF3P61204 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF3P61204 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF3P61204 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF3P61204 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF3P61204 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF3P61204 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF3P61204 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF3P61204 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF3P61204 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF3P61204 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF3P61204 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF3P61204 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF3P61204 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF3P61204 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF3P61204 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF3P61204 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF3P61204 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF3P61204 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF3P61204 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF3P61204 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF3P61204 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF3P61204 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF3P61204 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF3P61204 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF3P61204 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF3P61204 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARF3P61204 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF3P61204 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF3P61204 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF3P61204 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARF3P61204 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms