Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN8P56748 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN8P56748 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN8P56748 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN8P56748 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN8P56748 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN8P56748 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN8P56748 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN8P56748 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN8P56748 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN8P56748 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN8P56748 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN8P56748 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN8P56748 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN8P56748 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN8P56748 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN8P56748 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN8P56748 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN8P56748 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN8P56748 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN8P56748 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN8P56748 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms