Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNU13P55769 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNU13P55769 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNU13P55769 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNU13P55769 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNU13P55769 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNU13P55769 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNU13P55769 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNU13P55769 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNU13P55769 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNU13P55769 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNU13P55769 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNU13P55769 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNU13P55769 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNU13P55769 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNU13P55769 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNU13P55769 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNU13P55769 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNU13P55769 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNU13P55769 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNU13P55769 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNU13P55769 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNU13P55769 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNU13P55769 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNU13P55769 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNU13P55769 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNU13P55769 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNU13P55769 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNU13P55769 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNU13P55769 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNU13P55769 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNU13P55769 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNU13P55769 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNU13P55769 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNU13P55769 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNU13P55769 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNU13P55769 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNU13P55769 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNU13P55769 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNU13P55769 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNU13P55769 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNU13P55769 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNU13P55769 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNU13P55769 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNU13P55769 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNU13P55769 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNU13P55769 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNU13P55769 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNU13P55769 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNU13P55769 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNU13P55769 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNU13P55769 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNU13P55769 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNU13P55769 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNU13P55769 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNU13P55769 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNU13P55769 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNU13P55769 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNU13P55769 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNU13P55769 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNU13P55769 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNU13P55769 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNU13P55769 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNU13P55769 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNU13P55769 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNU13P55769 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms