Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC34.01■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
SMARCA4P51532 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC34■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC34■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SMARCA4P51532 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms