Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPT1P50897 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPT1P50897 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPT1P50897 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPT1P50897 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPT1P50897 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPT1P50897 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPT1P50897 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PPT1P50897 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PPT1P50897 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPT1P50897 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPT1P50897 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPT1P50897 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPT1P50897 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPT1P50897 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPT1P50897 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPT1P50897 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPT1P50897 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPT1P50897 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPT1P50897 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPT1P50897 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPT1P50897 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPT1P50897 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPT1P50897 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPT1P50897 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPT1P50897 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PPT1P50897 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPT1P50897 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PPT1P50897 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms