Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRE11P49959 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRE11P49959 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRE11P49959 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRE11P49959 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRE11P49959 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRE11P49959 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRE11P49959 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRE11P49959 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRE11P49959 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRE11P49959 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRE11P49959 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRE11P49959 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRE11P49959 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRE11P49959 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRE11P49959 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRE11P49959 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRE11P49959 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRE11P49959 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRE11P49959 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRE11P49959 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRE11P49959 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRE11P49959 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRE11P49959 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRE11P49959 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRE11P49959 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRE11P49959 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRE11P49959 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MRE11P49959 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRE11P49959 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRE11P49959 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRE11P49959 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRE11P49959 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRE11P49959 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRE11P49959 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRE11P49959 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRE11P49959 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRE11P49959 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRE11P49959 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRE11P49959 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRE11P49959 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRE11P49959 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRE11P49959 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRE11P49959 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRE11P49959 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRE11P49959 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRE11P49959 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRE11P49959 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRE11P49959 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRE11P49959 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRE11P49959 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRE11P49959 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRE11P49959 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRE11P49959 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRE11P49959 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRE11P49959 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRE11P49959 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRE11P49959 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRE11P49959 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRE11P49959 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRE11P49959 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MRE11P49959 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRE11P49959 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRE11P49959 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRE11P49959 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRE11P49959 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRE11P49959 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MRE11P49959 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRE11P49959 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRE11P49959 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRE11P49959 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRE11P49959 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRE11P49959 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRE11P49959 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRE11P49959 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRE11P49959 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRE11P49959 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRE11P49959 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MRE11P49959 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRE11P49959 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRE11P49959 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRE11P49959 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRE11P49959 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRE11P49959 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRE11P49959 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRE11P49959 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MRE11P49959 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRE11P49959 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRE11P49959 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRE11P49959 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRE11P49959 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRE11P49959 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRE11P49959 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRE11P49959 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRE11P49959 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRE11P49959 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRE11P49959 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRE11P49959 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRE11P49959 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRE11P49959 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms