Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLK1P49759 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLK1P49759 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLK1P49759 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLK1P49759 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLK1P49759 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLK1P49759 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLK1P49759 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLK1P49759 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLK1P49759 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLK1P49759 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLK1P49759 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLK1P49759 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLK1P49759 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLK1P49759 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLK1P49759 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLK1P49759 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLK1P49759 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLK1P49759 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLK1P49759 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLK1P49759 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLK1P49759 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLK1P49759 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLK1P49759 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLK1P49759 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLK1P49759 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLK1P49759 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLK1P49759 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLK1P49759 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLK1P49759 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLK1P49759 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLK1P49759 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLK1P49759 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLK1P49759 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLK1P49759 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLK1P49759 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLK1P49759 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLK1P49759 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLK1P49759 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLK1P49759 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLK1P49759 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLK1P49759 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLK1P49759 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLK1P49759 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLK1P49759 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLK1P49759 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLK1P49759 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLK1P49759 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLK1P49759 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLK1P49759 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLK1P49759 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLK1P49759 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLK1P49759 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLK1P49759 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLK1P49759 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLK1P49759 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLK1P49759 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLK1P49759 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLK1P49759 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLK1P49759 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLK1P49759 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLK1P49759 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLK1P49759 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLK1P49759 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLK1P49759 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLK1P49759 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLK1P49759 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLK1P49759 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLK1P49759 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLK1P49759 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLK1P49759 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms