Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK8P49336 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK8P49336 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK8P49336 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK8P49336 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK8P49336 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK8P49336 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK8P49336 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK8P49336 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK8P49336 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK8P49336 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK8P49336 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK8P49336 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK8P49336 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK8P49336 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK8P49336 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK8P49336 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK8P49336 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK8P49336 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK8P49336 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK8P49336 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK8P49336 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK8P49336 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK8P49336 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK8P49336 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK8P49336 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK8P49336 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK8P49336 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK8P49336 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK8P49336 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK8P49336 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK8P49336 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK8P49336 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK8P49336 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK8P49336 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK8P49336 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK8P49336 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK8P49336 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK8P49336 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK8P49336 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK8P49336 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK8P49336 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK8P49336 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK8P49336 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK8P49336 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK8P49336 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK8P49336 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK8P49336 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK8P49336 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK8P49336 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK8P49336 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK8P49336 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK8P49336 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK8P49336 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK8P49336 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK8P49336 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK8P49336 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK8P49336 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK8P49336 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK8P49336 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK8P49336 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK8P49336 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK8P49336 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK8P49336 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK8P49336 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK8P49336 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK8P49336 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK8P49336 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK8P49336 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK8P49336 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK8P49336 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK8P49336 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK8P49336 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK8P49336 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK8P49336 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK8P49336 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK8P49336 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK8P49336 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK8P49336 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK8P49336 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK8P49336 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK8P49336 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK8P49336 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK8P49336 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK8P49336 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK8P49336 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK8P49336 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK8P49336 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK8P49336 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK8P49336 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK8P49336 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK8P49336 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK8P49336 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK8P49336 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK8P49336 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK8P49336 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK8P49336 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK8P49336 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK8P49336 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDK8P49336 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms