Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NESP48681 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NESP48681 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NESP48681 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NESP48681 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
NESP48681 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
NESP48681 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NESP48681 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NESP48681 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NESP48681 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NESP48681 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NESP48681 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NESP48681 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NESP48681 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NESP48681 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
NESP48681 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NESP48681 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
NESP48681 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NESP48681 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
NESP48681 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NESP48681 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
NESP48681 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NESP48681 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
NESP48681 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NESP48681 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NESP48681 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NESP48681 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NESP48681 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NESP48681 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NESP48681 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NESP48681 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NESP48681 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NESP48681 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NESP48681 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NESP48681 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NESP48681 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NESP48681 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NESP48681 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NESP48681 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NESP48681 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NESP48681 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NESP48681 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NESP48681 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NESP48681 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NESP48681 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NESP48681 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NESP48681 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NESP48681 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NESP48681 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NESP48681 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
NESP48681 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
NESP48681 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NESP48681 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
NESP48681 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NESP48681 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NESP48681 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NESP48681 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NESP48681 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
NESP48681 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NESP48681 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NESP48681 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NESP48681 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NESP48681 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NESP48681 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NESP48681 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NESP48681 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NESP48681 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NESP48681 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NESP48681 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NESP48681 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NESP48681 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NESP48681 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NESP48681 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NESP48681 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NESP48681 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NESP48681 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NESP48681 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NESP48681 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
NESP48681 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NESP48681 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NESP48681 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NESP48681 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NESP48681 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NESP48681 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NESP48681 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NESP48681 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
NESP48681 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NESP48681 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NESP48681 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NESP48681 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NESP48681 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NESP48681 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NESP48681 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NESP48681 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
NESP48681 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
NESP48681 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
NESP48681 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NESP48681 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NESP48681 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NESP48681 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms