Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTDSS1P48651 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTDSS1P48651 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTDSS1P48651 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTDSS1P48651 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTDSS1P48651 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTDSS1P48651 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTDSS1P48651 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTDSS1P48651 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTDSS1P48651 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTDSS1P48651 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTDSS1P48651 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTDSS1P48651 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTDSS1P48651 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTDSS1P48651 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTDSS1P48651 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTDSS1P48651 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTDSS1P48651 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTDSS1P48651 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms