Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA4P48169 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms