Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
IQGAP1P46940 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IQGAP1P46940 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms