Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GNPDA1P46926 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms