Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRXP46100 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRXP46100 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRXP46100 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRXP46100 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRXP46100 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRXP46100 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRXP46100 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRXP46100 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRXP46100 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRXP46100 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRXP46100 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRXP46100 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRXP46100 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRXP46100 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRXP46100 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRXP46100 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRXP46100 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRXP46100 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRXP46100 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRXP46100 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRXP46100 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRXP46100 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRXP46100 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRXP46100 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRXP46100 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRXP46100 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRXP46100 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRXP46100 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRXP46100 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRXP46100 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRXP46100 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRXP46100 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRXP46100 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRXP46100 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRXP46100 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRXP46100 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRXP46100 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRXP46100 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRXP46100 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRXP46100 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRXP46100 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRXP46100 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRXP46100 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRXP46100 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRXP46100 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRXP46100 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRXP46100 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRXP46100 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRXP46100 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRXP46100 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRXP46100 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRXP46100 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRXP46100 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRXP46100 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRXP46100 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRXP46100 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRXP46100 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRXP46100 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRXP46100 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRXP46100 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRXP46100 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRXP46100 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRXP46100 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRXP46100 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRXP46100 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRXP46100 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRXP46100 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRXP46100 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRXP46100 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRXP46100 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRXP46100 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRXP46100 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRXP46100 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRXP46100 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ATRXP46100 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATRXP46100 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATRXP46100 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATRXP46100 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATRXP46100 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATRXP46100 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATRXP46100 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATRXP46100 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATRXP46100 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATRXP46100 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATRXP46100 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATRXP46100 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATRXP46100 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATRXP46100 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATRXP46100 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATRXP46100 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATRXP46100 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATRXP46100 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATRXP46100 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRXP46100 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRXP46100 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRXP46100 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRXP46100 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRXP46100 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRXP46100 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms