Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPOP42166 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPOP42166 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPOP42166 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPOP42166 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPOP42166 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPOP42166 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPOP42166 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMPOP42166 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMPOP42166 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMPOP42166 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMPOP42166 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMPOP42166 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMPOP42166 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMPOP42166 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMPOP42166 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMPOP42166 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMPOP42166 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMPOP42166 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMPOP42166 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMPOP42166 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMPOP42166 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMPOP42166 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMPOP42166 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMPOP42166 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMPOP42166 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMPOP42166 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMPOP42166 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMPOP42166 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMPOP42166 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMPOP42166 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMPOP42166 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMPOP42166 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMPOP42166 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMPOP42166 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMPOP42166 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMPOP42166 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMPOP42166 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMPOP42166 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMPOP42166 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPOP42166 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPOP42166 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPOP42166 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPOP42166 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPOP42166 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPOP42166 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPOP42166 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPOP42166 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPOP42166 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPOP42166 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPOP42166 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPOP42166 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPOP42166 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPOP42166 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPOP42166 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPOP42166 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMPOP42166 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMPOP42166 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMPOP42166 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMPOP42166 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMPOP42166 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMPOP42166 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMPOP42166 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMPOP42166 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TMPOP42166 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMPOP42166 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMPOP42166 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMPOP42166 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMPOP42166 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMPOP42166 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMPOP42166 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMPOP42166 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMPOP42166 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPOP42166 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPOP42166 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPOP42166 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPOP42166 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPOP42166 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPOP42166 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPOP42166 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPOP42166 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPOP42166 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPOP42166 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPOP42166 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPOP42166 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPOP42166 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPOP42166 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPOP42166 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPOP42166 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPOP42166 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPOP42166 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPOP42166 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPOP42166 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPOP42166 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPOP42166 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPOP42166 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMPOP42166 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMPOP42166 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMPOP42166 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMPOP42166 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms