Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms