Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN2P35609 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN2P35609 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms