Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPC1P35052 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPC1P35052 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPC1P35052 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPC1P35052 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPC1P35052 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPC1P35052 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPC1P35052 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPC1P35052 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPC1P35052 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPC1P35052 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPC1P35052 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPC1P35052 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPC1P35052 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPC1P35052 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GPC1P35052 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPC1P35052 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPC1P35052 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GPC1P35052 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPC1P35052 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPC1P35052 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPC1P35052 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPC1P35052 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPC1P35052 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPC1P35052 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPC1P35052 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPC1P35052 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPC1P35052 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPC1P35052 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPC1P35052 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPC1P35052 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPC1P35052 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPC1P35052 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPC1P35052 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPC1P35052 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPC1P35052 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPC1P35052 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPC1P35052 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPC1P35052 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GPC1P35052 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPC1P35052 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPC1P35052 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GPC1P35052 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPC1P35052 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPC1P35052 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPC1P35052 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPC1P35052 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPC1P35052 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPC1P35052 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPC1P35052 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPC1P35052 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPC1P35052 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPC1P35052 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPC1P35052 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPC1P35052 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPC1P35052 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPC1P35052 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPC1P35052 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPC1P35052 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPC1P35052 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPC1P35052 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPC1P35052 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPC1P35052 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPC1P35052 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPC1P35052 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPC1P35052 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPC1P35052 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPC1P35052 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPC1P35052 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPC1P35052 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPC1P35052 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPC1P35052 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPC1P35052 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPC1P35052 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPC1P35052 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GPC1P35052 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GPC1P35052 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GPC1P35052 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GPC1P35052 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPC1P35052 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPC1P35052 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPC1P35052 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPC1P35052 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPC1P35052 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPC1P35052 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPC1P35052 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPC1P35052 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPC1P35052 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPC1P35052 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPC1P35052 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC1P35052 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC1P35052 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC1P35052 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC1P35052 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC1P35052 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC1P35052 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC1P35052 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC1P35052 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC1P35052 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPC1P35052 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms