Protein–RNA interactions for Protein: P31249

HOXD3, Homeobox protein Hox-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3P31249 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HOXD3P31249 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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HOXD3P31249 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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HOXD3P31249 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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HOXD3P31249 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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HOXD3P31249 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXD3P31249 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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