Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMOD1P29536 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms