Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID4AP29374 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms