Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ABCD3P28288 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms