Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DNMT1P26358 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
DNMT1P26358 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms