Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5A1P25705 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5A1P25705 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5A1P25705 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5A1P25705 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5A1P25705 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5A1P25705 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5A1P25705 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5A1P25705 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5A1P25705 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5A1P25705 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms