Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP4AP20648 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP4AP20648 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP4AP20648 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP4AP20648 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP4AP20648 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP4AP20648 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP4AP20648 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP4AP20648 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP4AP20648 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP4AP20648 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP4AP20648 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP4AP20648 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP4AP20648 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP4AP20648 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP4AP20648 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP4AP20648 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP4AP20648 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP4AP20648 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP4AP20648 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP4AP20648 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP4AP20648 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP4AP20648 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP4AP20648 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP4AP20648 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP4AP20648 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP4AP20648 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP4AP20648 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP4AP20648 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP4AP20648 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP4AP20648 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP4AP20648 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP4AP20648 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP4AP20648 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP4AP20648 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms