Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF3P18847 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF3P18847 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF3P18847 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF3P18847 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF3P18847 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF3P18847 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF3P18847 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF3P18847 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF3P18847 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF3P18847 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF3P18847 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF3P18847 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF3P18847 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF3P18847 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF3P18847 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF3P18847 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF3P18847 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF3P18847 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF3P18847 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF3P18847 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF3P18847 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF3P18847 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF3P18847 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF3P18847 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF3P18847 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF3P18847 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF3P18847 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF3P18847 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF3P18847 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF3P18847 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF3P18847 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF3P18847 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF3P18847 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF3P18847 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF3P18847 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF3P18847 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF3P18847 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF3P18847 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF3P18847 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF3P18847 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF3P18847 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF3P18847 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF3P18847 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF3P18847 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF3P18847 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF3P18847 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF3P18847 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF3P18847 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF3P18847 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF3P18847 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF3P18847 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF3P18847 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF3P18847 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF3P18847 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF3P18847 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF3P18847 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF3P18847 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF3P18847 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF3P18847 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF3P18847 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF3P18847 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF3P18847 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF3P18847 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF3P18847 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF3P18847 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF3P18847 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF3P18847 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF3P18847 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF3P18847 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF3P18847 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF3P18847 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF3P18847 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF3P18847 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF3P18847 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF3P18847 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF3P18847 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF3P18847 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF3P18847 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF3P18847 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF3P18847 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF3P18847 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF3P18847 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF3P18847 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF3P18847 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF3P18847 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF3P18847 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF3P18847 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF3P18847 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF3P18847 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF3P18847 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF3P18847 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ATF3P18847 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF3P18847 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF3P18847 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF3P18847 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF3P18847 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF3P18847 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF3P18847 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF3P18847 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms