Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EGR1P18146 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR1P18146 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR1P18146 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR1P18146 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR1P18146 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR1P18146 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR1P18146 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR1P18146 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR1P18146 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR1P18146 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR1P18146 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR1P18146 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR1P18146 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR1P18146 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR1P18146 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR1P18146 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR1P18146 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR1P18146 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR1P18146 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR1P18146 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR1P18146 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR1P18146 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR1P18146 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EGR1P18146 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR1P18146 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR1P18146 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR1P18146 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR1P18146 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR1P18146 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR1P18146 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR1P18146 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR1P18146 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR1P18146 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR1P18146 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR1P18146 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR1P18146 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR1P18146 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR1P18146 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR1P18146 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR1P18146 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR1P18146 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR1P18146 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR1P18146 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR1P18146 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR1P18146 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR1P18146 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR1P18146 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR1P18146 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR1P18146 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR1P18146 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR1P18146 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR1P18146 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR1P18146 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR1P18146 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR1P18146 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EGR1P18146 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR1P18146 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR1P18146 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR1P18146 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR1P18146 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR1P18146 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR1P18146 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR1P18146 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR1P18146 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR1P18146 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR1P18146 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR1P18146 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR1P18146 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR1P18146 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR1P18146 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR1P18146 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR1P18146 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR1P18146 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR1P18146 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR1P18146 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR1P18146 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR1P18146 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR1P18146 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR1P18146 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR1P18146 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR1P18146 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR1P18146 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR1P18146 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR1P18146 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR1P18146 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EGR1P18146 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR1P18146 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms