Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMPD1P17405 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPD1P17405 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms