Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODC1P11926 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ODC1P11926 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODC1P11926 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ODC1P11926 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ODC1P11926 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODC1P11926 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODC1P11926 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODC1P11926 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODC1P11926 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODC1P11926 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODC1P11926 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODC1P11926 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODC1P11926 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODC1P11926 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODC1P11926 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODC1P11926 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODC1P11926 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ODC1P11926 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODC1P11926 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODC1P11926 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODC1P11926 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODC1P11926 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODC1P11926 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODC1P11926 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ODC1P11926 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODC1P11926 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODC1P11926 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODC1P11926 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODC1P11926 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODC1P11926 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODC1P11926 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ODC1P11926 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ODC1P11926 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODC1P11926 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODC1P11926 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODC1P11926 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODC1P11926 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODC1P11926 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODC1P11926 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ODC1P11926 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ODC1P11926 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODC1P11926 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODC1P11926 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODC1P11926 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODC1P11926 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODC1P11926 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODC1P11926 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODC1P11926 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODC1P11926 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODC1P11926 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ODC1P11926 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODC1P11926 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ODC1P11926 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODC1P11926 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ODC1P11926 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODC1P11926 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ODC1P11926 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODC1P11926 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODC1P11926 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODC1P11926 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ODC1P11926 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODC1P11926 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ODC1P11926 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODC1P11926 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODC1P11926 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODC1P11926 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODC1P11926 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODC1P11926 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODC1P11926 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODC1P11926 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODC1P11926 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ODC1P11926 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODC1P11926 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODC1P11926 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODC1P11926 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODC1P11926 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODC1P11926 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ODC1P11926 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODC1P11926 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODC1P11926 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODC1P11926 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODC1P11926 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODC1P11926 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ODC1P11926 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ODC1P11926 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODC1P11926 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODC1P11926 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODC1P11926 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ODC1P11926 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODC1P11926 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODC1P11926 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODC1P11926 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODC1P11926 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODC1P11926 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ODC1P11926 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODC1P11926 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODC1P11926 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODC1P11926 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ODC1P11926 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms