Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RALAP11233 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RALAP11233 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RALAP11233 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RALAP11233 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RALAP11233 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RALAP11233 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RALAP11233 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RALAP11233 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RALAP11233 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RALAP11233 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RALAP11233 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RALAP11233 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RALAP11233 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RALAP11233 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RALAP11233 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RALAP11233 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RALAP11233 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RALAP11233 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RALAP11233 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RALAP11233 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RALAP11233 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RALAP11233 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RALAP11233 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RALAP11233 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RALAP11233 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RALAP11233 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RALAP11233 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RALAP11233 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RALAP11233 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RALAP11233 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RALAP11233 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RALAP11233 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RALAP11233 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RALAP11233 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RALAP11233 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RALAP11233 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RALAP11233 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RALAP11233 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RALAP11233 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RALAP11233 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RALAP11233 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RALAP11233 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RALAP11233 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RALAP11233 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RALAP11233 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RALAP11233 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RALAP11233 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RALAP11233 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RALAP11233 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RALAP11233 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RALAP11233 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RALAP11233 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RALAP11233 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RALAP11233 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RALAP11233 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RALAP11233 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RALAP11233 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RALAP11233 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RALAP11233 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RALAP11233 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RALAP11233 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RALAP11233 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RALAP11233 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RALAP11233 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RALAP11233 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RALAP11233 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RALAP11233 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RALAP11233 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RALAP11233 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RALAP11233 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RALAP11233 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RALAP11233 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RALAP11233 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RALAP11233 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RALAP11233 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RALAP11233 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RALAP11233 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RALAP11233 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RALAP11233 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RALAP11233 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RALAP11233 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RALAP11233 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RALAP11233 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RALAP11233 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RALAP11233 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RALAP11233 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RALAP11233 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RALAP11233 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RALAP11233 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RALAP11233 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RALAP11233 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RALAP11233 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RALAP11233 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RALAP11233 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RALAP11233 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RALAP11233 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RALAP11233 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RALAP11233 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RALAP11233 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms