Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RARBP10826 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RARBP10826 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RARBP10826 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RARBP10826 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RARBP10826 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RARBP10826 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RARBP10826 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RARBP10826 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RARBP10826 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RARBP10826 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RARBP10826 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
RARBP10826 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RARBP10826 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RARBP10826 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RARBP10826 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RARBP10826 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RARBP10826 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RARBP10826 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RARBP10826 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RARBP10826 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RARBP10826 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RARBP10826 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RARBP10826 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RARBP10826 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RARBP10826 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RARBP10826 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RARBP10826 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RARBP10826 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RARBP10826 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RARBP10826 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RARBP10826 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RARBP10826 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RARBP10826 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RARBP10826 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RARBP10826 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RARBP10826 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RARBP10826 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RARBP10826 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RARBP10826 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARBP10826 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARBP10826 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARBP10826 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARBP10826 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARBP10826 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARBP10826 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARBP10826 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARBP10826 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARBP10826 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARBP10826 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARBP10826 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARBP10826 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARBP10826 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARBP10826 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARBP10826 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARBP10826 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RARBP10826 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARBP10826 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARBP10826 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARBP10826 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RARBP10826 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARBP10826 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARBP10826 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARBP10826 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARBP10826 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARBP10826 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARBP10826 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARBP10826 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARBP10826 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RARBP10826 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RARBP10826 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RARBP10826 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RARBP10826 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RARBP10826 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RARBP10826 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RARBP10826 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RARBP10826 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RARBP10826 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RARBP10826 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RARBP10826 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RARBP10826 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RARBP10826 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RARBP10826 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RARBP10826 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RARBP10826 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RARBP10826 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RARBP10826 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RARBP10826 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RARBP10826 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RARBP10826 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RARBP10826 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RARBP10826 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RARBP10826 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RARBP10826 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RARBP10826 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RARBP10826 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RARBP10826 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARBP10826 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARBP10826 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARBP10826 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms