Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CT47B1P0C2W7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CT47B1P0C2W7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
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