Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPM2P07951 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPM2P07951 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPM2P07951 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPM2P07951 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPM2P07951 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPM2P07951 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPM2P07951 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPM2P07951 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TPM2P07951 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPM2P07951 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPM2P07951 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPM2P07951 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPM2P07951 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPM2P07951 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPM2P07951 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPM2P07951 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPM2P07951 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPM2P07951 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPM2P07951 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPM2P07951 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPM2P07951 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TPM2P07951 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TPM2P07951 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TPM2P07951 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TPM2P07951 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TPM2P07951 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TPM2P07951 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TPM2P07951 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TPM2P07951 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPM2P07951 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPM2P07951 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPM2P07951 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPM2P07951 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPM2P07951 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPM2P07951 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPM2P07951 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPM2P07951 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPM2P07951 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPM2P07951 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPM2P07951 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPM2P07951 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPM2P07951 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPM2P07951 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPM2P07951 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPM2P07951 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPM2P07951 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPM2P07951 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TPM2P07951 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TPM2P07951 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPM2P07951 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPM2P07951 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPM2P07951 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPM2P07951 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPM2P07951 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPM2P07951 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPM2P07951 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPM2P07951 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPM2P07951 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPM2P07951 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPM2P07951 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPM2P07951 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPM2P07951 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPM2P07951 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPM2P07951 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPM2P07951 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPM2P07951 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TPM2P07951 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPM2P07951 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPM2P07951 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPM2P07951 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPM2P07951 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPM2P07951 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPM2P07951 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TPM2P07951 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPM2P07951 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPM2P07951 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPM2P07951 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPM2P07951 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPM2P07951 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPM2P07951 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPM2P07951 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPM2P07951 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPM2P07951 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPM2P07951 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPM2P07951 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPM2P07951 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TPM2P07951 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPM2P07951 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPM2P07951 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPM2P07951 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPM2P07951 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPM2P07951 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPM2P07951 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPM2P07951 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPM2P07951 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPM2P07951 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPM2P07951 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPM2P07951 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPM2P07951 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms