Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC1P02654 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC1P02654 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC1P02654 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC1P02654 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC1P02654 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC1P02654 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC1P02654 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC1P02654 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC1P02654 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC1P02654 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC1P02654 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC1P02654 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC1P02654 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC1P02654 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC1P02654 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC1P02654 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC1P02654 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC1P02654 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC1P02654 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC1P02654 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC1P02654 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC1P02654 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC1P02654 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC1P02654 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC1P02654 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC1P02654 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC1P02654 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC1P02654 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC1P02654 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC1P02654 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC1P02654 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC1P02654 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC1P02654 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC1P02654 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC1P02654 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC1P02654 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC1P02654 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC1P02654 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC1P02654 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC1P02654 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC1P02654 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC1P02654 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC1P02654 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC1P02654 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC1P02654 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC1P02654 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC1P02654 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC1P02654 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC1P02654 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC1P02654 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC1P02654 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC1P02654 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOC1P02654 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOC1P02654 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOC1P02654 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOC1P02654 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOC1P02654 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOC1P02654 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms