Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE8BO95263 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE8BO95263 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE8BO95263 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE8BO95263 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE8BO95263 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE8BO95263 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE8BO95263 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE8BO95263 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE8BO95263 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE8BO95263 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE8BO95263 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE8BO95263 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE8BO95263 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE8BO95263 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE8BO95263 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms