Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRP5O75197 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRP5O75197 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRP5O75197 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRP5O75197 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRP5O75197 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRP5O75197 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRP5O75197 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRP5O75197 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRP5O75197 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRP5O75197 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LRP5O75197 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRP5O75197 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRP5O75197 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LRP5O75197 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRP5O75197 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRP5O75197 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRP5O75197 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRP5O75197 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRP5O75197 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRP5O75197 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRP5O75197 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRP5O75197 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRP5O75197 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRP5O75197 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRP5O75197 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRP5O75197 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRP5O75197 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRP5O75197 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRP5O75197 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRP5O75197 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRP5O75197 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRP5O75197 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRP5O75197 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRP5O75197 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRP5O75197 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRP5O75197 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRP5O75197 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRP5O75197 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRP5O75197 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRP5O75197 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRP5O75197 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRP5O75197 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRP5O75197 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRP5O75197 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRP5O75197 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRP5O75197 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRP5O75197 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRP5O75197 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRP5O75197 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRP5O75197 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRP5O75197 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRP5O75197 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRP5O75197 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRP5O75197 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRP5O75197 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRP5O75197 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRP5O75197 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRP5O75197 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRP5O75197 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRP5O75197 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRP5O75197 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRP5O75197 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRP5O75197 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRP5O75197 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRP5O75197 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRP5O75197 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRP5O75197 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRP5O75197 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRP5O75197 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRP5O75197 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRP5O75197 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRP5O75197 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRP5O75197 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRP5O75197 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRP5O75197 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRP5O75197 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRP5O75197 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP5O75197 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP5O75197 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP5O75197 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP5O75197 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP5O75197 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP5O75197 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP5O75197 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP5O75197 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRP5O75197 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP5O75197 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP5O75197 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP5O75197 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP5O75197 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP5O75197 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP5O75197 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP5O75197 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP5O75197 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP5O75197 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP5O75197 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP5O75197 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP5O75197 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRP5O75197 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms