Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPFIA3O75145 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms