Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNSO60931 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNSO60931 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNSO60931 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNSO60931 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNSO60931 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNSO60931 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNSO60931 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNSO60931 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNSO60931 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNSO60931 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNSO60931 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNSO60931 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNSO60931 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNSO60931 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNSO60931 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNSO60931 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNSO60931 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNSO60931 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNSO60931 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNSO60931 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNSO60931 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNSO60931 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNSO60931 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNSO60931 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNSO60931 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNSO60931 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNSO60931 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNSO60931 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNSO60931 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNSO60931 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNSO60931 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNSO60931 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNSO60931 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNSO60931 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNSO60931 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNSO60931 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNSO60931 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNSO60931 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNSO60931 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNSO60931 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNSO60931 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNSO60931 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNSO60931 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNSO60931 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNSO60931 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNSO60931 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNSO60931 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNSO60931 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNSO60931 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNSO60931 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNSO60931 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNSO60931 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNSO60931 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNSO60931 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNSO60931 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNSO60931 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNSO60931 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNSO60931 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNSO60931 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNSO60931 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNSO60931 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNSO60931 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNSO60931 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNSO60931 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNSO60931 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNSO60931 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNSO60931 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNSO60931 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNSO60931 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNSO60931 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNSO60931 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNSO60931 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNSO60931 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNSO60931 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNSO60931 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNSO60931 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNSO60931 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNSO60931 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNSO60931 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNSO60931 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNSO60931 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNSO60931 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNSO60931 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNSO60931 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNSO60931 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNSO60931 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNSO60931 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNSO60931 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNSO60931 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNSO60931 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNSO60931 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNSO60931 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNSO60931 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNSO60931 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNSO60931 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNSO60931 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNSO60931 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNSO60931 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNSO60931 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms