Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUBNO60494 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUBNO60494 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUBNO60494 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUBNO60494 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUBNO60494 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUBNO60494 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUBNO60494 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUBNO60494 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUBNO60494 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUBNO60494 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUBNO60494 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUBNO60494 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUBNO60494 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUBNO60494 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUBNO60494 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUBNO60494 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUBNO60494 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CUBNO60494 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUBNO60494 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUBNO60494 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUBNO60494 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUBNO60494 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUBNO60494 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CUBNO60494 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUBNO60494 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUBNO60494 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUBNO60494 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUBNO60494 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUBNO60494 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUBNO60494 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUBNO60494 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUBNO60494 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUBNO60494 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CUBNO60494 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUBNO60494 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUBNO60494 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUBNO60494 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CUBNO60494 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUBNO60494 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUBNO60494 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUBNO60494 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUBNO60494 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUBNO60494 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CUBNO60494 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUBNO60494 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUBNO60494 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUBNO60494 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUBNO60494 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUBNO60494 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUBNO60494 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUBNO60494 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUBNO60494 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUBNO60494 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUBNO60494 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUBNO60494 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUBNO60494 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUBNO60494 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUBNO60494 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUBNO60494 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUBNO60494 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUBNO60494 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUBNO60494 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms