Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSNA1O43805 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms