Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX6O43752 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX6O43752 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STX6O43752 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX6O43752 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX6O43752 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX6O43752 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX6O43752 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX6O43752 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX6O43752 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX6O43752 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX6O43752 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX6O43752 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX6O43752 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX6O43752 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX6O43752 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX6O43752 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX6O43752 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX6O43752 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX6O43752 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX6O43752 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX6O43752 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX6O43752 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX6O43752 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX6O43752 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX6O43752 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX6O43752 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX6O43752 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX6O43752 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX6O43752 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX6O43752 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX6O43752 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX6O43752 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX6O43752 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX6O43752 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX6O43752 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STX6O43752 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX6O43752 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX6O43752 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX6O43752 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX6O43752 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX6O43752 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX6O43752 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX6O43752 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX6O43752 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX6O43752 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX6O43752 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX6O43752 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX6O43752 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX6O43752 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX6O43752 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX6O43752 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX6O43752 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX6O43752 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX6O43752 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX6O43752 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX6O43752 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
STX6O43752 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
STX6O43752 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX6O43752 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX6O43752 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX6O43752 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX6O43752 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX6O43752 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX6O43752 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX6O43752 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
STX6O43752 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX6O43752 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX6O43752 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX6O43752 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX6O43752 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX6O43752 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX6O43752 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX6O43752 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX6O43752 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX6O43752 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX6O43752 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX6O43752 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX6O43752 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
STX6O43752 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX6O43752 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX6O43752 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX6O43752 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STX6O43752 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STX6O43752 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
STX6O43752 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
STX6O43752 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STX6O43752 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STX6O43752 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STX6O43752 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
STX6O43752 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STX6O43752 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STX6O43752 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX6O43752 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX6O43752 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX6O43752 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX6O43752 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX6O43752 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX6O43752 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX6O43752 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms